Когнитивная психология и эмоции
Субъективные заметки аспиранта-психолога
Записи в рубрике «R»

Видео лекций по статистике и R на русском

6 февраля 2014, анализ данных Метки: , ,

Институт Биоинформатики выложил видеозаписи нашего с Анатолием Карповым курса по статистике и R. Задумка курса заключалась в том, чтобы попробовать объяснять биологам статистику так, как она обычно дается гуманитариям — на простых примерах с минимумом математики. Курс вышел очень сжатым — у нас было всего 14 занятий на теорию и практику с нуля. Надеюсь, несмотря на эту сжатость, все же что-то удалось объяснить.

Если у вас видео не проигрывается, вот прямая ссылка: http://www.youtube.com/watch?v=jE2bgVl2xPk&feature=share&list=PLjKdf6AHvR-GOGfUrUJ8c6La_Fq5s2O0U

R — быстрое считывание и объединение csv файлов

28 июля 2013, анализ данных Метки: ,

Топорный вариант (медленный):

data <- data.frame()
for (i in file_list){
   data <- rbind.fill(data, read.csv(i, stringsAsFactors=F))
}

Быстрый вариант:

data <- do.call("rbind.fill", lapply(file_list, 
              FUN = function(i) read.csv(i, stringsAsFactors=F))
                )

stringsAsFactors важно, поскольку, если в первом файле представлены не все уровни фактора, при объединении может получиться ерунда

Google Developers опубликовали серию видео по R

12 июля 2013, анализ данных Метки: ,

Видео посвящены базовым моментам работы с R и разного рода программистким штукам, таким как написанию функций. Ниже первое видео, всего их сейчас 21, полный список можно увидеть, нажав на кнопку плейлист.

Grouped forest plots using ggplot2

19 июля 2012, анализ данных Метки: , , , , ,

I decided to write this post in English, as I need to practice in writing more.

As I currently do some meta-analytic stuff, I needed to get a proper plot of the results of analysis. The existing solutions are hard to customize, so I decided to do something by myself. Basically, the forest plot is a errorbar plot of effect sizes, plus a list of studies, plus some other stuff, usually a list of effect sizes.
продолжение »

Задачка на сегодня

15 июля 2012, анализ данных Метки: , , , , ,

Задачка на сегодня — научиться рисовать такую хрень подобного рода таблографик в ggplot2.

"Лесной" график (forest plot) из metafor

«Лесной» график (forest plot) из metafor

Самое сложное — это сделать легенду, чтоб не вручную координаты прописывать.